DSKA Medlemsportræt

Lise Barlebo Ahlborn

MSc, PhD, Molekylærbiolog

Medlem af NGC arbejdsgruppen for fortolkning

Baggrund

• Molecular biologist, Center for Genomic Medicin, 2018 – Present
  Oncogenetics - Interpretation of genetics analyses for hereditary cancers
  Genomic tumor profiling to guide targeted cancer treatment
  Genomic tumor profiling from liquid biopsies (circulating tumor DNA)
  Development and implementation of liquid biopsies in the clinical setting
   
• PhD student, The Phase I Unit, Department of Oncology and Center for Genomic Medicine, 2015 – 2018
  Early phase clinical studies
  Targeted cancer treatment
  Liquid biopsies
  Cell-free DNA
  Circulating tumor DNA
  Digital droplet PCR (ddPCR)
  Next generation sequencing (NGS)
   
• Molecular Biologist, Center for Genomic Medicine, 2013 - 2015
  Oncogenetic patient diagnostics (main focus on breast- and ovarian cancer)
  Processing and analysis of next-generation sequencing (NGS) data (Illumina)
   
• Research Associate, Center of Genomic Medicine, 2012 – 2013
  Processing of oncogenic breast- and ovarian cancer analysis using Next Generation sequencing
   
• Student Assistant, Department of Clinical Genetics, 2011 – 2012
• MSc Molecular Biomedicine, Københavns Universitet 2008-2013

 
Find mig på LinkedIn: https://www.linkedin.com/in/lise-ahlborn-82a12a86/

Hvorfor har du ønsket at være med i NGC arbejdsgruppen for fortolkning?

Jeg har primært ønsket at være med i arbejdsgruppen for fortolkning, for at sikre ensartet og optimal variantfortolkning på tværs af landet i NGC regi.
På Genomisk Medicin  på Rigshospitalet har vi mange års erfaring med fortolkning af germline analyser indenfor bl.a. arvelig cancer, hvor vi laver > 6000 analyser om året. Desuden har vi et omfattende samarbejde med de onkologiske afdelinger omkring somatiske tumoranalyser. En af disse afdelinger er Fase1 enheden på Rigshospitalet, hvor omfattende genomiske analyser af tumorvæv guider valget af målrettet kræftbehandling. Mere end 500 patienter om året får lavet disse analyser der inkluderer, helgenom og RNA-sekventering af tumorvæv samt SNP-array for større kromosomale forandringer. Jeg har siden 2013 arbejdet med netop disse germline og somatiske analyser, og er på denne baggrund valgt ind i gruppen for fortolkning. 

Hvad vil du bruge din stemme i gruppen til?

Forhåbentlig kan vi hjælpe NGC med at implementere de rette værktøjer og software, så vi kan sikre en optimal og ensartet variantfortolkning, der i sidste ende kommer patienterne til gode. Det er i hvert fald et stærkt hold af fortolkningseksperter NGC har fået med, så mon ikke der kommer noget rigtig godt ud af arbejdet og vi også kan lære lidt af hinanden.